Краевые цветки василька содержат гликозиды, флавоноиды, витамины, дубильные вещества, минеральные соли, красящие вещества и алкалоиды.
Препараты, приготовленные из василька синего, обладают потогонным, жаропонижающим, мочегонным и антимикробным свойствами. Кроме того, василёк оказывает желчегонное действие. Растение расслабляет, заживляет раны, обезболивает. А также василёк является средством, снимающим спазм гладкой мускулатуры внутренних органов, улучшающим пищеварительные процессы и возбуждающим аппетит. 
Василёк применяют при кашле, простуде, отёке сердца и почек, цистите, нефрите и уретрите. Также растение является средством, улучшающим пищеварение. Василёк используют для примочек при глазных болезнях, заболеваниях кожи, слепоте.
Желтуха, глисты, лихорадка, колики, подагра – ещё один список недугов, от которых можно избавиться при помощи василька. В народной медицине растение используется при головных болях, для очищения крови. А также василёк применяют для составления травяных сборов и чаев.